연말정산 vs 5월 종합소득세 차이점 비교 분석

연말정산과 5월 종합소득세 “둘 다 세금 정산”이라서 헷갈립니다.
그런데 누가 하는지(회사 vs 나)부터 다릅니다.

이걸 이해하면 “왜 환급/추가납부가 생기는지”도 정리가 됩니다.
그래서 이 글은 두 제도를 딱 잘라 구분해서 비교합니다.

연말정산은 회사가 1년치 ‘월급 세금’을 2월 급여에서 최종 계산해 정산하는 것이고,
5월 종합소득세는 내가 여러 소득을 합쳐 신고하는 것입니다.

구분 기준	연말정산(회사 정산)	5월 종합소득세(내가 신고)
한 줄 뜻	“월급에서 미리 낸 세금”을 1년 기준으로 회사가 다시 계산	“여러 소득”을 1년치로 내가 합쳐서 신고
누가 처리?	회사(원천징수의무자)가 정산, 나는 서류만 제출	본인(납세자)이 직접 신고(홈택스 등)
어떤 소득?	근로소득(월급) 중심	근로소득 + 사업/연금/기타소득 등 합산
언제?	법에 “다음 해 2월분 급여를 줄 때 정산”이라고 적혀 있음	통상 다음 해 5월에 신고
결과는?	① 환급(돌려받음) 또는 ② 추가 납부(더 냄)	① 납부할 세금 확정 또는 ② 환급/추가납부 정리
대표적으로 ‘해야 하는 사람’	회사 다니는 근로자 대부분	국세청 안내: 2곳 이상 근무했는데 합산 연말정산을 안 함 / 연말정산을 했어도 다른 소득이 있음

방법·해결책

연말정산은 “학교 간식비 정산”처럼 생각하면 쉽습니다.

그리고 5월 종합소득세는 이렇게 생각하면 됩니다.

Q1. “연말정산이랑 5월 종합소득세는 같은 말” 아닌가요?
아닙니다. 연말정산은 회사가 하는 월급세금 정산, 종합소득세는 내가 하는 1년 소득 신고입니다.

Q2. “회사에서 연말정산 했으면 5월 신고는 절대 안 해도 돼요?”
대부분은 맞지만, 국세청이 딱 예외를 적어놨습니다.

Q3. 환급받으면 무조건 좋은 건가요?
환급은 “보너스”가 아니라 미리 낸 세금이 더 많아서 되돌려받는 것입니다. (추가 납부가 나와도 이상한 게 아닙니다.)

5월 신고 대상인데 안 하면 신고/납부 관련 불이익이 생길 수 있습니다. 그래서 먼저 “내가 신고 대상인지”를 위 표 기준으로 확인해야 합니다.
연말정산에서 공제를 빠뜨렸다면, 요건에 따라 경정청구로 바로잡을 수 있습니다. 현행 조문(2026.1.1 시행) 기준으로 법정신고기한이 지난 후 5년 이내 청구 규정이 있습니다.

※ 적용은 소득 종류, 근무 형태, 해당 연도 규정에 따라 달라질 수 있습니다.